Centrum Onkologii - Instytut im. Marii Skłodowskiej-Curie, Oddział w Krakowie (COOK) prowadzi działalność naukowo-badawczą, diagnostyczno-leczniczą, profilaktyczną oraz dydaktyczną w zakresie rozpoznawania i leczenia nowotworów złośliwych, zajmuje się także epidemiologią onkologiczną. Krakowskie Centrum jest na terenie województwa małopolskiego jedyną placówką mogącą świadczyć w dziedzinie onkologii kompleksowe usługi diagnostyczne i terapeutyczne ( chirurgia, radio-, chemio-, immuno- i hormonoterapia). Badania diagnostyczne wykonywane są w Zakładach: Patologii Nowotworów (badania morfologiczne), Analityki i Biochemii Klinicznej (diagnostyka labolatoryjna) oraz Radiologii i Diagnostyki Obrazowej (badania obrazowe radiologia konwencjonalna, mammografia, ultrasonografia, tomografia komputerowa i rezonans magnetyczny). Zakład Fizyki Medycznej prowadzi prace w zakresie dozymetrii klinicznej, komputerowego planowania leczenia i kontroli jakości urządzeń radioterapeutycznych. W COOK znajduje się – znacznie rozbudowana w ostatnich latach – Przychodnia Przykliniczna, Zakład Radioterapii (z Pracownią Brachyterapii HDR) oraz Kliniki: Chirurgii Onkologicznej (w tym Oddział Zabiegowy Urologii Onkologicznej), Nowotworów Głowy i Szyi, Nowotworów Piersi i Klatki Piersiowej, Nowotworów Jamy Brzusznej oraz Nowotworów Układowych i Uogólnionych, a także Zakład Radiobiologii Klinicznej i Pracownia Epidemiologii. W COOK działa ponadto Poradnia Genetyczna, obejmująca opieką rodziny tzw. wysokiego ryzyka dziedzicznie uwarunkowanego zachorowania na nowotwory, a także Oddział Chemioterapii Dziennej i Oddział Chirurgii Jednego Dnia, gdzie wykonywane są zabiegi niewymagające hospitalizacji. Powstanie oddziałów dziennych w COOK pozwoliło na znaczne skrócenie czasu oczekiwania pacjentów na leczenie, a co za tym idzie zwiększenie liczby chorych leczonych w szpitalu. W 2008 roku w krakowskim Oddziale Centrum Onkologii leczono 15 476 chorych, a w Przychodni Przyklinicznej udzielono 102 543 porad.